基序

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英文motif的缩写。

也翻译为“模序”,“模体”

DNA,蛋白质等生物大分子中的保守序列

例如,在反式作用因子的结构中,基序一般指构成任何一种特征序列的基本结构,作为结构域中的亚单元,其功能是体现结构域的多种生物学作用。

反式作用因子的DNA结合结构域(DNA binding domain)中的几种常见基序:

①螺旋/转角/螺旋(Helix-turn-helix,HTH)基序

两段螺旋被一短的转角结构分开,其中一段螺旋为DNA识别螺旋.

同源异形结构域(Homeodomain,由同源异形盒编码)中含有HTH基序。具有Homeodomain的转录调控蛋白胚胎发育和正常细胞分化基因表达调节中有重要作用。

②锌指(Zinc finger)基序

链的保守序列中的一对组氨酸加一对半胱氨酸(His2/Cys2)或2对半胱氨酸(cys2/cys2)与一个锌离子形成配位键,这些氨基酸对之间的多肤链成环状突出并折迭成指形结构,多个指结构常串联重复。

锌指族转录因子二聚体形式同DNA上的顺式调控元件结合。

含锌指基序的转录因子:与GC盒结合的SPl、类固醇激素受体家族,抑癌蛋白WT1等。

亮氨酸拉链(Leucine-Zipper)基序

由一段每隔6个a a 就有一个Leu的伸展肽链组成,这些周期性出现的Leu都位于α-螺旋的同—侧面,因此两条均含Leu拉链基序的蛋白质通过亮氨酸侧链的相互作用形成二聚体。

具有亮氨酸拉链基序的转录因子:原癌基因C-Jun/C-fos(APl家族)

④螺旋-环-螺旋(Helix-loop-Helix,HLHt)基序.

由2个α螺旋间隔一个非螺旋的环(loop)组成.

如原癌基因产物C-myc及其结合蛋白Max.

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